Основные - да, надо.
НО:
Попробуйте все вот эти смайлы, которые вы видите, плюс еще некоторые, запхнуть в одно окно. В них будет совершенно нереально разобраться. Можете посмотреть любой сайт, могу для примера привести несколько, где все доп. смайлы в одном окне. Они как минимум НИКОГДА не используются потому что искать в такой куче смайликов нужный совершенно неудобно.
Поэтому - редкие смайлы нужно либо удалять, либо как я говорю переносить в подкатегории, мы хотя бы не знаем будет это удобно, или нет.
ВСЕ смайлы выносить в подкатегорию будет 100% неудобно, их будет так же легко вставить, как и зайти на смайловый сайт и скопировать картинку оттуда.
Идея 2:
Просто сделать чтобы смайлики были в том же порядке, как сейчас, но открывались как спойлер - чтобы они не занимали место и не качались когда не нужны.